Διοικητικό Συμβούλιο
Ο ΕΛΟΤ διοικείται από εννεαμελές Διοικητικό Συμβούλιο, πενταετούς θητείας.
Το ανώτατο εκτελεστικό όργανο της εταιρείας είναι ο Διευθύνων Σύμβουλος..
Συμβούλιο πιστοποίησης
Στα θέματα πιστοποίησης λειτουργούν στον ΕΛΟΤ όργανα λήψης αποφάσεων, τα οποία είναι έτσι διαρθρωμένα, ώστε να μην επικρατεί σε αυτά κανένα κυρίαρχο ή δεσπόζον συμφέρον. Κυρίαρχο όργανο είναι το ενδεκαμελές Συμβούλιο Πιστοποίησης (ΣΠ) που συστήνεται με απόφαση του Διοικητικού Συμβουλίου του ΕΛΟΤ. Ο Πρόεδρος και ο Αντιπρόεδρος του Συμβουλίου Πιστοποίησης διορίζονται με απόφαση του Διοικητικού Συμβουλίου του ΕΛΟΤ.